مأموریت اصلی بخش تحقیقات اصلاح و تهیه بذر چغندرقند، انجام پژوهش و تولید دانش فنی با هدف افزایش بهره‌وری و تحقق تولید پایدار چغندرقند است. این مأموریت در محورهای زیر دنبال می‌شود:

• به‌نژادی و به‌زراعی: انجام تحقیقات بنیادین و کاربردی در زمینه اصلاح نژاد و بهبود روش‌های کاشت، داشت و برداشت چغندرقند؛
• ارائه راهکارهای فنی: توسعه و معرفی راهکارهای علمی و کاربردی به منظور رفع چالش‌های تولید و افزایش عملکرد چغندرقند؛
• انتقال یافته‌ها: انتقال نتایج پژوهش‌ها به توصیه‌های اجرایی و انتقال دانش فنی به مزارع کشاورزان.

1. پژوهش‌های منطقه‌ای: انجام مطالعات به‌نژادی و به‌زراعی در مناطق مختلف استان، شامل کشت پاییزه و بهاره چغندرقند
2. نوآوری و معرفی ارقام: اجرای تحقیقات هدفمند برای دستیابی به ارقام اصلاح‌شده چغندرقند و معرفی آن‌ها به منظور تأمین نیازهای استان؛
3. کارهای پژوهشی: مشارکت با دانشگاه‌ها، مراکز آموزش عالی و مؤسسات تحقیقاتی جهت اجرای پروژه‌های مشترک؛
4. فعالیت‌های علمی: انتشار نتایج تحقیقاتی در قالب مقالات علمی، سمینارها و کنفرانس‌های ملی و بین‌المللی، نمایشگاه‌ها و دوره‌های آموزشی؛
5. ارتباط با صنعت: نظارت بر کارخانه‌های قند به منظور افزایش کارایی سیستم عیارسنجی و ارائه دوره‌های آموزشی مرتبط؛
6. خدمات مشاوره‌ای تخصصی: ارائه مشاوره‌های فنی و تحقیقاتی برای تدوین سیاست‌ها، خط‌مشی‌ها و نظارت دقیق بر فعالیت تولیدکنندگان چغندرقند استان.